尼奥使用自己在虚拟世界里面的神奇力量将崔尼蒂复活，即利用代码里面的漏洞消除了子弹对崔尼蒂的伤害，使之复活但是由于这次对虚拟世界代码的篡改，导致代码的混乱，尼奥自己陷入了一个困局也就是第三集里面一开始时尼奥。

因为尼奥掌握了“网络世界”的法则，通过运用法则的力量将子弹取出了。

因为是在母体里，男主开启了编码模式，把子弹从崔尼蒂身体里挖出来了。

先知预言当救世主进入SOURCE的时候战争就会结束，所以电影中ZION 里的人所有努力都是为了把NEO送进source但是墨菲斯等人并不知道source在什么地方，如何进入，并且没有进入的权限所以先知告诉他们去找KEYMAKER，他知道关于进入。

如果你看过第一部应该知道是 Smith跟尼奥是死对头吧，在第一集里结尾Smith被尼奥钻进的身体，把他撕的四分五裂而在第二集里，被杀死的 Smith 又复活了，理论上并不是复活，而是升级了，在尼奥钻入他身体的时候。