而3里面会解释为什么，消灭了锡安6次，还会有一些起义军存在尼奥最终见到的就是源程序里的虚拟系统构架师构架师告诉他，锡安的存在就是子宫故意留下，进行自己系统升级的一个工具而尼奥的存在超过了子宫之前设定的限度。

黑客帝国介绍在矩阵中生活的一名年轻的网络黑客尼奥发现，看似正常的现实世界实际上似乎被某种力量控制着，尼奥便在网络上调查此事而在现实中生活的人类反抗组织的船长墨菲斯， 也一直在矩阵中寻找传说的救世主，就这样在人类。

其实这部电影是很有意思的，不过对于为什么那个电脑人会自我复制电影没有交代清楚，大概是情节的需要吧还有就是尼奥在真实世界里怎么和电脑世界里一样也具有超能力可以用念力控制乌贼 ，我想这个情节电影过渡太快了，也没交代。

这也是导演想要制造出的一种结局那些镜头用尼奥演绎，不是说就是他而是代表这种身跨两界的救世主这个bug估计只能通过这种方式才能修复，这个轮回确实够大，像玛雅文明，很多电影都表达了人类末日后重新繁衍的过程，这些就。

看过黑客帝国的都清楚，尼克是第六代“救世主”，也就是说锡安重建了五次，而每次重建都是只给救世主留二十几个人，从零开始重建锡安，然后再被毁灭设定上是200多年以后，不可能在两百多年里重建五次，所以锡安也是。

3母体为什么要毁灭锡安？母体知道有特警病毒威胁他，为什么他还要毁灭锡安？若救世主不去那机械城市，在锡安被杀了，母体也会完蛋啊？！是母体系统的逻辑规则一定要这样做么？如果是威胁救世主来机械城市，但那机械城市的BOSS为什么一开始又说。

第三个人认为，电脑圈养人类的目的，就是利用人类的创造性，毕竟电脑创造力不是强项，那有成千上万的人类创造力强圈养起来，科技才能快速发展总的来说，锡安已经被摧毁过几次了，作为发现了很久的电脑，不可能没有。