第三部讲述了在黑客帝国系列电影最后一集中，延续上集黑客帝国2重装上阵的故事，并揭晓机器与人类的最终命运面对如潮的电子乌贼，人类城市危在旦夕，墨菲斯和崔妮蒂等欲与入侵者决一死战此时，“救世主”尼奥。

尼奥和史密斯全都死了，而整个系统也彻底崩溃了，只能让设计师重新开发新的系统原因史密斯感染了作为诱饵的尼奥，使机器大帝掌握了删除史密斯和尼奥的办法，最后以尼奥为进入矩阵的通道注入了大量的删除代码，导致尼奥的大脑。

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1黑客帝国梗概影片讲述一名年轻的网络黑客尼奥发现看似正常的现实世界实际上是由一个名为“矩阵”的计算机人工智能系统控制的尼奥在一名神秘女郎崔妮蒂的引导下见到了黑客组织的首领墨菲斯，三人走上了抗争矩阵的征途。

黑客帝国3结局解析如下黑客帝国3以主要人物尼奥史密斯双双衰亡，整个系统崩溃为结局结局中史密斯感染了尼奥设下的病毒，机器大帝因此掌握了删除史密斯和尼奥方法，最后尼奥进入矩阵注入了大量的删除代码，导致尼奥的。

结局尼奥和史密斯全都死了，而整个系统也彻底崩溃了，只能让设计师重新开发新的系统黑客帝国是由华纳兄弟公司发行的系列动作片，该片由沃卓斯基兄弟执导，基努·里维斯凯莉·安妮·莫斯劳伦斯·菲什伯恩等主演影片。