主持参与多项重大城市发展战略、城市规划研究项目，如北京城市总体规划修编、江苏省南通市城市历史与发展研究、天津城市空间发展战略研究、北京城市空间发展战略研究、江苏省徐州市城市空间发展战略研究、江苏省常武地区空间发展规划、江苏省无锡县县域规划、江苏省无锡市空间发展规划、江苏省苏州市及苏州地区空间发展规划、江苏省张家港市城市总体规划纲要等。此外还参加北京、秦皇岛、北戴河、邯郸、保定、唐山、北海、厦门、桂林、酒泉、张家港、苏州 、无锡、柳州等城市的总体规划工作。

主持参与多项城市设计、建筑设计项目，如山东省泰安市泰山博物馆、江苏省南京市金陵红楼梦博物馆、江苏省南通博物馆、山东省济南市城市设计、北京白塔寺地区旧城改造规划设计、曲阜孔子研究院、中央美术学院及美院附中校园规划、中国历史博物馆改扩建工程前期方案、北京市菊儿胡同危旧房改建新四合院工程、海南省三亚市中心区城市设计、广西省桂林市中心区控制性详细规划、北京天安门广场扩建规划设计、北京长安街规划设计、北京汇通祠修复工程、北京图书馆建筑方案设计（为中选方案的五位建筑师之一）等。

主持参与多项重大科研课题，如中长期规划（科技部研究课题）、中国城市化与文化发展（子课题：城市化进程中的城市文化研究，中国工程院科研项目）、京津冀北（大北京地区）城乡空间发展规划研究 （建设部重点项目）、中国住宅2000研究、可持续发展的中国人居环境：基本理论与典型案例研究（国家自然科学基金“九五”项目）、滇西北人居环境可持续发展规划研究、东北亚地区城市化发展新途径研究、发达地区城市化进程中建筑环境的保护与发展研究（国家自然科学基金“八五”重点项目，与同济大学、东南大学合作）、亚洲城市研究网（加拿大国际开发署项目；与加拿大不列颠哥伦比亚大学人居研究中心合作）等。

长期从事建筑、城市规划教育工作，培养了大量建设人才；参与创建中国建筑学会等多个全国性专业学术团体，历任中国建筑学会副秘书长、常务理事、副理事长、顾问，中国城市科学研究会副理事长、顾问，中国城市规划学会理事长、顾问，北京市科学技术协会副主席，并担任国内建筑和城市规划专业刊物的主编。此外，曾经任职多个国际性学术组织，如曾任世界人类聚居学会主席、副主席、理事，国际建筑师协会副主席、理事，国际城市与区域规划家学会理事等。

吴良镛院士荣誉

1990年，国家教委授予其北京奥林匹克建设规划研究科学进步一等奖；
1990年，国家教委授予其著作《广义建筑学》科学进步一等奖；
1992年，北京市菊儿胡同危旧房改建试点工程获度的亚洲建筑师协会金质奖，在联合国总部获世界人居奖（英国住房和社会住宅基金会）；
1995年，获何梁何利科技进步奖；
1996年，国际建筑师协会授予国际建协教育/评论奖；
1999年，法国政府授予法国文化艺术骑士勋章；
2000年，国家建设部授予首届“梁思成建筑奖”；
2001年，发达地区城市化进程中建筑环境的保护与发展研究获中国高校科学技术二等奖；
2002年，荷兰克劳斯亲王基金会授予2002年度克劳斯亲王奖；以南京大学杰出校友身份出席南京大学百年华诞庆祝活动。
2003年，著作《京津冀地区城乡空间发展规划研究》获第11届全国优秀科技图书一等奖，第六届国家图书奖提名奖；
2003年，中央美术学院及附属中学新校园规划设计获教育部优秀建筑设计奖；
2004年，获北京市高等教育教学成果一等奖；
2012年2月14日，荣获2011年度国家最高科学技术奖。
2012年5月，吴良镛被评选为南京大学（原名国立中央大学）十大杰出校友之一。
此外还获得有国务院、国家教育部、科技部、北京市政府等颁发的全国先进工作者、特殊贡献奖、北京市先进工作者等奖项。

出版著作

出版著作16部， 此外还参与编纂书籍多套，发表学术文章200多篇。
1、 《中国院士书系，建筑·城市·人居环境》，河北教育出版社，2003
2、京津冀地区城乡空间发展规划研究. 北京：清华大学出版社，2002
3、国际建协《北京宪章》——建筑学的未来（五种文字版），北京：清华大学出版社，2002
4、吴良镛画记，北京：读书·生活·新知三联出版社，2002
5、 学术文化随笔，北京：青年出版社，2002
6、人居环境科学导论，北京：中国建筑工业出版社，2001；
7、 世纪之交的凝思：建筑学的未来，北京：清华大学出版社，1999；
8、 发达地区城市化进程中建筑环境的保护与发展，北京：中国建筑工业出版社，1999；
9、 北京旧城与菊儿胡同（英文），温哥华：加拿大哥伦比亚大学出版社，1999；
10、 迎接新世纪的来临－－吴良镛城市研究论文，北京：中国建筑工业出版社，1996；
11、北京旧城与菊儿胡同，北京：中国建筑工业出版社，1994；
12、 我国建设事业的今天和明天（与周干峙、林志群合作），北京：中国城市出版社，1994；
13、广义建筑学，清华大学出版社出版，1990；台北：地景出版社（繁体），1992；
14、城市规划设计论文集，北京：燕山出版社，1987；
15、 中国古代城市史纲（英文），卡塞尔：西德卡塞尔大学，1985；
16、城乡规划（全国通用教材，清华大学与同济、南工、重建工四校合作），北京：中国建筑工业出版社，1961。